Pagrindinis projekto tikslas

Projekto tikslas nustatyti genomo žymenis, telomerų ilgį, epigenomo (DNR metilinimo), fenotipinius žymenis ir jų derinius, leidžiančius anksti numatyti su amžiumi susijusią sarkopeniją ir išsekimo sindromą.

Siekiant šio tikslo bus išsamiai apibūdinti senyvo amžiaus žmonių,vyresnių nei 65 metų amžiaus, turinčių sarkopenijos ir išsekimo sindromo požymius (atvejis)  ir be jų (kontrolė) fenotipo žymenis. Taikant šiuolaikines didelio našumo genotipavimo technologijas bus įvertinti tiriamųjų viso genomo informatyvių CpGs salų DNR metilinimo lygiai; bus atlikta plataus masto epigenomo, genomo irfenomo asociacijų analizė. Pagal telomerų ilgį ir epigenetinį laikrodį bus nustatytas tiriamųjų biologinis amžius.

Įgyvendinus šį projektą, bus identifikuoti nauji molekuliniai žymenys, kurie leistų sukurti algoritmą ir metodines rekomendacijas ankstyvai sarkopenijos ir išsekimo sindromo diagnostikai.

Problematika / Anotacija

Sarkopenija ir senatvinis išsekimo sindromas yra pagrindiniai geriatriniai sindromai, kurie didina senyvo amžiaus asmenų sergamumą ir mirštamumą. Šių glaudžiai susijusių geriatrinių sindromų patogenezė nėra visiškai aiški.

Iki šiol nėra priimtų vieningų praktinių ankstyvos diagnostikos metodų. Dėl to siekiant šių sindromų prevencijos, diagnozės, gydymo ir prognozės būtina suprasti jų molekulinius mechanizmus. Tam reikalingas platus senstančio organizmo ištyrimas taikant sistemų biologijos (genomikos, epigenomikos, proteomikos ir kt.) technologijas.

Naujausi senatvinio išsekimo sindromo tyrimai rodo, kad specifinės genetinės savybės yra susijusios su organizmo energijos apykaita, biologinių procesų reguliavimu, pažintinėmis funkcijomis ir uždegimu.

Neseniai buvo pasiūlyta, kad epigenetinis senėjimas (įvertintas pagal DNR metilinimo amžiaus pagreitį), epigenetinis laikrodis ir telomerų ilgis yra glaudžiai susiję su įvairiais ligos fenotipais.

Be to, telomerų ilgis plačiai laikomas molekuliniu senėjimo proceso požymiu. Tačiau eksperimentinių DNR metilinimo, telomerų ilgio duomenų ir pagrindines amžiaus koreliacijas su genomo profiliu bei klinikiniu fenotipu, patvirtinančiais sąsajas su sarkopenija ir išsekimo sindromu, yra nedaug.

GEPITEL projektas išspręs visas šias iškilusias problemas. Senėjimą moduliuojančios genomo-epigenomo-fenomo sąveikos molekulinė analizė padės nustatyti sarkopenijos ir išsekimo sindromo žymenis.